浙贝母肌动蛋白基因的克隆及生物信息学分析

《中成药》 冯亚斌[1];施鑫磊[1];俞信光[1];沈晓霞[2];江建铭[2];王忠华[1]
摘要:
目的克隆浙贝母Fritillaria thunbergii Miq.肌动蛋白(Actin)基因,并进行生物信息学分析。方法提取浙贝母根、茎、叶、花、鳞茎总RNA,设计合成简并引物。以叶片总RNA为模板,通过RT-PCR和Ta克隆技术克隆Actin基因保守区序列片段。以该基因为内参基因,对3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因进行组织特异性表达分析。结果经RT-PCR扩增和Ta克隆,得到1段基因序列(463 bp)。浙贝母Actin基因与岷江百合郁金香、虎眼万年青、铁皮石斛、柿子、光皮桦、玉米相似度较高(84%-98%),其氨基酸序列与阿帝露茅膏菜、甘蓝型油菜、香草兰、岷江百合、麻疯树、枸杞、红海榄的同源性均在89%以上,并且其Actin蛋白与百脉根、岷江百合郁金香亲缘关系较近。HMGR基因在该植物各部位表达有显著差异,依次为鳞茎〉花〉叶〉茎〉根。结论首次从浙贝母中克隆出Actin基因(命名为Ft Actin),可为其有效利用奠定基础。
浙贝母 , 肌动蛋白(Actin)基因 , 克隆 , 生物信息学分析
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