基于高通量测序的青叶胆转录组研究

《中国现代应用药学》 吴昕怡;严媛;刘小莉
摘要:
目的探讨青叶胆中獐牙菜苦苷生物合成的遗传基础。方法采用Illumina Hiseq 2500高通量测序技术,对青叶胆全草进行转录组测序。结果共获得68 643个unigene,平均长度901 bp,共有42 954条unigene注释到NR,Swiss Prot,COG,KOG,GO,Pfam数据库中,獐牙菜苦苷生物合成的3个阶段中,有43条unigene参与中间体的生成,3条unigene参与萜类骨架合成,25条unigene可能参与萜类最后的修饰。结论首次对青叶胆转录组进行测序分析,获得了可能参与獐牙菜苦苷生物合成的候选基因,为后续功能基因的挖掘奠定了基础。
青叶胆 , 转录组 , ILLUMINA , Hiseq , 2500 , 獐牙菜苦苷
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