应用微卫星多态分析四个鲤鱼群体的遗传多样性

《动物学研究》 全迎春 [1];孙效文 [2];梁利群 [2]
摘要:
选择12个斑马鱼功能基因的微卫星标记和12个鲤鱼微卫星标记,检测黑龙江鲤(Cyprinus carpio haematopterus Temminck et Schlegel)、散鳞镜鲤(C. carpio)、荷包红鲤抗寒品系(C. carpio var. wuyuanensis)、松浦鲤(C. carpio Songpu carp)的群体遗传多样性.共检测到3 882个扩增片段,长度为126~489 bp,在群体间扩增出1~5个等位基因不等,共计59个等位基因,平均等位基因2.46个.数据经PHYLIP V3.6软件估算和MEGA3软件作图,确立4个群体间的亲缘关系.并应用Bootstrap检验估计系统树中节点的自引导值,并进行了系统发生分析.结果表明:①4个群体检测的有效等位基因数都在55个以上,平均观测杂合度为0.36~0.43,平均期望杂合度为0.49~0.53,平均多态信息含量为0.21~0.25,说明这几个群体多态性属于中度偏高水平,遗传多样性较高;②群体间相似系数都在0.84以上,遗传距离较近,为0.067~0.170,与前人研究结果一致.聚类分析显示,松浦鲤与散鳞镜鲤亲缘关系最近,荷包红鲤抗寒品系与它们的亲缘关系较黑龙江鲤更近;③在3个斑马鱼功能基因相关的微卫星位点上,黑龙江鲤缺失特异扩增条带,这可能与几种鱼类的育成史有关.
鲤鱼 , 微卫星 , 群体多样性 , 分子标记
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