基于ITS2序列广陈皮基原植物及药材的DNA分子鉴定

《广东药科大学学报》 成树森[1,2];王武静[1];陈超志[1];段元静[1];任玲[1];王秋红[1];李书渊[1]
摘要:
目的选取ITS2序列对广陈皮基原植物及药材进行鉴定,为DNA条形码技术应用于广陈皮药材的鉴定研究提供理论依据。方法提取样品DNA,利用PCR技术对样品进行核基因ITS2片段扩增并双向测序。所得序列经Codon Code Aligner拼接后,用MEGA6.0软件进行数据分析;计算种内、种间Kimura-2-Parameter(K2P)遗传距离并采用邻接法构建NJ系统树。结果广陈皮种内最大K2P遗传距离远小于种间最小K2P遗传距离;由构建的系统聚类树可以看出,广陈皮基原植物及药材聚成一支,并与其他近缘种植物明显分开。广陈皮药材的测序成功率明显低于原植物的测序成功率,年份越高的广陈皮测序成功率越低。结论 ITS2序列作为DNA条形码可以有效地鉴别广陈皮基原植物及药材与其他近缘种植物,为广陈皮药材基原鉴定及临床安全用药提供了分子依据。
广陈皮 , 柑橘 , 近缘种 , ITS2 , 分子鉴定
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