小桐子JcYkt6基因的克隆和表达分析

《植物生理学报》 黄尧瑶[1];邓明华[3];龚明[4];陈浩维[1];施卫省[2];文锦芬[2]
摘要:
以小桐子(Jatropha curcas)c DNA为模版,克隆了Jc Ykt6基因的CDS序列。序列分析表明该基因包含600 bp完全阅读框(ORF),编码199个氨基酸。预测其编码蛋白质的分子量为22.53 k Da,等电点为6.90。Blast搜索结果及进化分析结果表明,Jc Ykt6蛋白与香瓜和黄瓜的Ykt6蛋白序列一致性最高(91%),亲缘关系最近。该基因编码的蛋白具有一个典型的VAMP基元。定量分析结果显示,Jc Ykt6基因在小桐子根、茎、叶、花、果皮和种子中都有表达,并且在种子中表达量最高。在种子生长发育的前期其表达水平不断增加,在种子生长发育的后期(50 d)达到最高值,然后下降。表达量变化过程与种子中储藏蛋白质合成趋势基本一致,推测其参与小桐子种子储藏蛋白质合成和运输。ABA、PEG、Na Cl、4°C和机械损伤处理下Jc Ykt6表达水平都不同程度上调,推测Jc Ykt6具有多种功能,可能参与小桐子非生物胁迫响应和激素信号传导。
小桐子 , SNARES , JcYkt6 , 克隆 , 生物信息学分析 , 表达分析
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