中国野生种葡萄mybA转录因子SNP特征分析

《植物遗传资源学报》 焦健[1];刘崇怀[1];樊秀彩[1];张颖[1];孙海生[1];姜建福[1];李民[1]
摘要:
以中国野生葡萄14个种为材料,对控制花色苷合成的mybA转录因子进行克隆和序列分析,获得VvmybAl和Vlmy—bA2两个转录因子的全长基因序列,共检测到121个SNP,表现出丰富的遗传多样性。3种中性检测方法比较序列变异模式,结果表明,中国野生种葡萄VvmybAJ和VlmybA2基因没有偏离中性模型,反映出基因漂移和选择性中性突变之间的平衡。不同野生种材料的mybA基因结构存在很高的同源相似性。但是在启动子区、内含子区以及第3个外显子区存在不同程度碱基的缺失、插入和替换,而且野生种葡萄mybA基因存在一些特有序列或突变,这些突变可以作为分子标记区分不同的野生种材料。通过基因结构比对和系统进化树分析,可将野生种葡萄细分为5个类群。初步推测桦叶葡萄和变叶葡萄进化地位较为原始。
中国野生葡萄 , mybA , 花色苷 , SNP , 遗传多样性
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