盐胁迫下西伯利亚蓼茎叶正反消减文库的构建及初步分析

《遗传》 刘关君[1];刘明坤[1];许志茹[1];阎秀峰[1];魏志刚[1];杨传平[1]
摘要:
正向文库以3%NaHCO3胁迫48h的材料(茎、叶)为实验方(tester),以未胁迫的材料(茎、叶)为消减方(driver);在负向文库中,以未胁迫的材料(茎、叶)为实验方(tester),以3%NaHCO3胁迫48h的材料(茎、叶)为消减方(driver),利用抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH)构建了3%NaHC03胁迫下西伯利亚蓼茎叶正反消减文库。从文库中共获得2282条有效EST序列,其中从茎正向消减文库中获得598条,从茎负向消减文库中获得490条,从叶正向消减文库中获得627条,从叶负向消减文库中获得567条。经BlastX序列比对后,通过MIPs方法对EST功能进行分类并对茎叶正反消减文库做了比较,其中茎与叶部除细胞救援与防御、转运组件中变化趋势相同外,在代谢、能量、光合作用、蛋白合成、转录和信号传导等方面均表现为相反趋势,另外通过荧光定量RT-PCR对12个潜在与盐胁迫相关基因进行定量分析,结果显示12个基因在未经胁迫与盐胁迫处理后的西伯利亚蓼叶与茎部有着很大差异,说明叶与茎部在NaHCO3条件下可能具有不同应答机制与分工,这有助于进一步理解西伯利亚蓼分子耐盐机制。
西伯利亚蓼 , 消减文库 , 盐胁迫 , 差异表达基因
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