玉米黑粉菌基因组编码蛋白作用位点的计算机预测

《西南农业学报》 黄婉[1];范成明[1];吴毅歆[1,2];何月秋[1,3]
摘要:
利用已公布的玉米黑粉病菌基因组全序列数据及信号肽预测软件SignalP v3.0、亚细胞器中蛋白定位分布预测软件TargetP v1.01、跨膜螺旋结构预测软件TMHMM v2.0和膜锚定位点预测软件Big-PI Predictor预测分析了玉米黑粉病菌基因组编码蛋白的作用位点。结果表明,在6522个ORF中,具有分泌功能的有543个,占全基因组基因总数的8.3%;作用位点在线粒体的有1552个,占全基因组基因总数的23.4%;具有跨膜结构的有1269个,占全基因组基因总数的19.5%;锚定在膜上的有56个,占全基因组基因总数的0.9%。
玉米黑粉病菌 , 基因组 , 亚细胞作用位点 , 计算机预测
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