利用WHO drug information来检索抗体药物蛋白质序列
2005年,世界卫生组织(WHO)就正式颁布了生物和生物技术治疗药物的INN(International Nonproprietary Names)命名方案,此后陆续公布了一系列按此方案命名的生物治疗药物INN名称,其中包括大量的抗体治疗药物。下面就介绍一些如何利用INN名称来检索抗体药物的蛋白质序列。
《世卫生组织药物信息》(WHO drug information)是关于药物开发和管制议题的季刊,每季刊物上均会有大量的药物命名,结构,序列以及修饰等信息,链接(http://www.who.int/medicines/publications/druginformation/innlists/en/)
在Search框内输入待查询的抗体药物INN名称,如恒瑞PD-1抗体camrelizumab
下载该PDF文件。该文件的药物排列顺序是按照首字母从A至Z排列的。很快就可以找到camrelizumab的蛋白质序列。
利用WHO drug information可以非常快捷和方便的查询到抗体的序列。当然也有以下三种情况是较难查询到抗体序列的:
该抗体并没有INN名称
WHO drug information并不会及时公布所有INN名称的抗体序列。例如Bevacizumab 2004年就在美国上市了,在WHO Drug Information, Vol. 30, No. 3, 2016上才公布其蛋白质序列。
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WHO drug information公布的蛋白质序列和其编码的核苷酸序列有差入。例如aflibercept序列:
融合蛋白重链C末端的Lys(C-K)残基由于多种羧肽酶的作用被完全去除,在最终产品中检测不到,所以INN公布的蛋白质序列中没有C-K,但是合成核苷酸时应该考虑进去。
对于如何检索利用WHO drug information查不到的抗体序列,后续还会详细讲解,欢迎持续关注。