摘要:
鳍足类Pinnipeds是海洋哺乳动物的重要类群，现存种类包括海象科Odobenidae、海狮科Otariidae和海豹科Phocidae的所有物种。在海豹属Phoca中，atp8基因的Ka／Ks最高，仅为0．0847（远小于1），因而海豹属所有线粒体蛋白质编码基因的选择压力均非常高。对于群海豹属Pusa，cox1、cox2和had3基因的Ka／Ks均为0，表明在这3个基因中，所有的核苷酸的替换均为同义替换，没有出现氨基酸的改变。科内、属内基因变异位点的分析表明，nctd5、had4和nadg基因可以作为cox1和cob基因辅助的分子标记。线粒体基因组的系统发育结果，强烈支持食肉目所有12个科均为单系群，并且鳍足类（海狮科、海象科和海豹科）为食肉目Carnivora内部的一个单系群（BPM=100，BPP=100）。在鳍足类内部，海狮科与海象科亲缘关系最近，聚类为海狮总科Otarioidea，然后与海豹科聚类：（海狮科十海象科）＋海豹科。在海豹科内部，线粒体基因组的证据支持将海豹科划分为2个亚科，即僧海豹亚科Monachinae和海豹亚科Phocinae。线粒体基因组的证据，强烈支持鼬科Mustelidae与浣熊科Procyonidae关系最近，臭鼬科Mephitidae与熊猫科Ailuridae近缘，同时，鳍足类与[（鼬科＋浣熊科）＋（臭鼬科＋熊猫科）]为姊妹群，而与熊科Ursidae较远。犬科Canidae在犬型亚目Caniformia中分化较早，位于犬型亚目的基部。
