北极狐及乌苏里貉抑制素α亚基基因克隆及生物信息学分析

《中国畜牧兽医》 张宇飞[1,2];李晓霞[1,2];王士勇[1,2];曹新燕[1,2];刁云飞[1,2];杨镒峰[1,2];陈秀敏[1,2];赵伟刚[1,2];赵蒙[1,2];魏海军[1,2];许保增[1,2]
摘要:
试验旨在克隆北极狐及乌苏里貉抑制素a(inhibin,INHa)亚基基因并对其进行生物信息学分析。根据GenBank中犬科INHa预测mRNA序列(登录号:XM—545660.5)设计1对引物,用RT-PCR技术从北极狐及乌苏里貉的卵巢组织中扩增出JiVHa亚基基因,同时将其插人到克隆载体中,进行测序及生物信息学分析。测序结果表明,北极狐及乌苏里貉的WHa亚基基因CDS序列全长为1107bP,编码369个氨基酸。北极狐及乌苏里貉的JiVHa亚基基因与犬的同源性最高,分别为97.9%与97.6%。系统进化树分析表明,北极狐及乌苏里貉与犬亲缘关系较近,同时也说明JiVHa亚基基因在不同物种及进化过程中具有高度保守性。对INHa亚基蛋白的高级结构预测发现,由于半胱氨酸间形成的二硫键导致其采用“蝴蝶形”或“开放手”构型,其中a-螺旋形成分子的“手腕”结构,B-折叠形成分子的“手指”结构。本研究成功克隆了北极狐及乌苏里貉的JiVHa亚基基因,同时进行了系统的生物信息学分析,为今后研究抑制素在卵母细胞一颗粒细胞同步发育过程中的生物学功能奠定了基础。
北极狐 , 乌苏里貉 , 抑制素a(INHa)亚基基因 , 克隆 , 生物信息学分析
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