斜带石斑鱼生长激素/催乳素家族基因cDNAs的分子克隆及其进化意义

《动物学研究》 贾海波[1];周莉[1];石耀华[1];桂建芳[1]
摘要:
从斜带石斑鱼垂体提取总RNA,再取其50 ng合成SMART cDNA.从所构建的垂体SMART cDNA质粒文库中筛选到生长激素/催乳素基因家族的2个成员的全长cDNA片段:生长激素(GH)基因全长为938 bp,编码204个氨基酸;催乳素基因(PRL)全长为1 429 bp,编码212个氨基酸.采用计算机软件Mega 2和CLUSTAL W1.64b对9种鱼的生长激素/催乳素基因家族的3个成员(GH、PRL和生长催乳素SL)的氨基酸序列进行系统分析,构建NJ分支系统树,对于序列中的插入/缺失位点则采用Pairaise Deletion,1 000次自展(Bootstrap)分析计算各节点支持率.根据3个基因的氨基酸序列构建的系统树表明,石斑鱼与金头鲷、金鲈和牙鲆聚成一类,虹鳟与大马哈鱼聚成一类,鲫鱼与鲶鱼聚成一类,鳗鲡成另外一类.根据石斑鱼全长cDNA推断的氨基酸序列比较表明,SL相对GH和PRL有较高的保守性.石斑鱼的GH、PRL和SL的氨基酸同源性在24%~31%,但其C-端的氨基酸同源性较高,尤其是C-端的3个Cys是严格保守的.其中SL与GH的同源性(30.8%)高于与PRL的同源性(25.6%),GH和PRL的同源性最低(24.1%).
斜带石斑鱼 , 生长激素/催乳素基因 , SMART , cDNA , 垂体 , 同源性
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