基因芯片法对苏州市结核临床分离株RFP耐药性快速检测价值的研究

《临床肺科杂志》 叶志坚[1];唐佩军[1];沈兴华[1];吴妹英[1];肖玉梅[1]
摘要:
目的 通过基因芯片法检测结核分离株RFP的耐药性,为在临床诊断中利用该法快速鉴别苏州市结核RFP耐药菌株的可靠性奠定基础.方法 收集痰液标本45例,利用罗氏固体培养法(金标准)对结核分枝杆菌进行传统药敏试验;利用晶芯结核分枝杆菌耐药检测试剂盒及相关仪器通过核酸提取、PCR扩增、芯片杂交和芯片扫描,对结核分枝杆菌RFP耐药相关基因rpoB的rpoB-RRDR 511,513,516,526,531和533位点进行检测,将基因芯片检测获得的RFP药敏判读结果与金标准法获得的结果进行比较分析;将17例经基因芯片检测过的菌株用PCR法扩增包含rpoB-RRDR的基因片段,经纯化后进行DNA直接测序,将基因芯片对rpoB-RRDR 526,531位点的检测结果与DNA测序获得的结果进行比较分析.结果 与金标准法相比,基因芯片法对菌株RFP药敏检测的准确率为93.3%(42/45);与DNA测序法相比,基因芯片法对rpoB-RRDR 526,531位点突变型检测的准确率为82.4%(14/17).结论 rpoB-RRDR 526,531位点突变是导致苏州市结核病RFP耐药的主要因素,通过基因芯片法对rpoB基因相关位点的检测可为临床对RFP耐药结核鉴定提供一种快速、准确和批量性的检测手段,具有极大的应用价值.
基因芯片 , 结核病 , 利福平 , 耐药 , DNA测序
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