北京鸭卵磷脂胆固醇酰基转移酶的cDNA和蛋白质的结构分析

《中国生物化学与分子生物学报》 曾武威[1];张坚[2];陈保生[1];吴钢[1];张可满[1];薛红[1]
摘要:
为获得不易感动脉粥样硬化动物北京鸭卵磷脂胆固醇酰基转移酶(LCAT)的cDNA蛋白质序列,分析其结构特点.以从北京鸭肝脏mRNA反转录获得的cDNA一链为模板,应用SMART-RACE技术,获得了北京鸭LCAT的cDNA序列,推导出其蛋白质氨基酸序列,应用分子生物学软件对该蛋白的一级、二级结构进行分析和比较.北京鸭LCAT cDNA(在GenBank中的注册号为AF324887)全长1 953 bp,其中开放阅读框架1 356 bp,编码451个氨基酸,包括一个由23个氨基酸构成的疏水性信号肽和一个由428个氨基酸组成的成熟蛋白.该成熟蛋白比人LCAT在C端多12个氨基酸,其与鸡、人、家兔的同源性依次为98%、83%和82%.与其它种属LCAT蛋白序列的比较结果表明,北京鸭LCAT蛋白质序列虽然在长度上和结构上与其它种属有一定的差异,但序列中与酶催化活性相关的序列均非常保守.
北京鸭 , 卵磷脂胆固醇酰基转移酶 , CDNA , 蛋白质结构
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