柠条锦鸡儿CkF5H基因及启动子的克隆

《华北农学报》 任方媛[1];李高[1];张涛[1];杨杞[1];王瑞刚[1]
摘要:
为了研究CkF5H基因在柠条锦鸡儿中木质素生物合成途径方面中的生物学功能,以我国西北干旱荒漠地区重要的豆科饲用灌木柠条锦鸡儿为材料,克隆了1个木质素合成相关的CkF5H基因,该基因cDNA全长1679bp,gDNA全长3495bp,具有2个外显子,1个内含子,编码520个氨基酸,GenBank登录号HQ829862。通过染色体步移的技术克隆了1550bp的启动子序列,对启动子序列上的响应元件进行了分析。结果显示,具有昼夜节律响应元件、防御与胁迫响应元件、赤霉素顺式作用元件和热响应元件等。CkF5H富含二级结构,其中α螺旋占39.81%,β折叠占15.96%,不规则卷曲占44.23%,并预测其三维结构。对CkF5H基因推导的氨基酸序列预测分析得出,CkF5H蛋白等电点为6.45,分子量为58.09ku,不稳定系数45.72,是不稳定蛋白,总平均亲水性-0.143,属亲水性蛋白。因此,克隆柠条锦鸡儿的CkF5H基因并详细分析,可为进一步研究该基因提供理论依据。
柠条锦鸡儿 , F5H , 基因克隆 , 木质素 , RACE
下载全文

相关文献