夜香树均一化全长cDNA文库的构建及EST分析

《热带亚热带植物学报》 郑鸿昌[1,3];刘涛[1];吕恃衡[1];陈建军[1];何水林[2];潘东明[1];陈桂信[1]
摘要:
为构建高质量的夜香树(Cestrum nocturnum)均一化全长cDNA文库,以其花朵为材料,采用DSN均一化技术与改进的SMART技术相结合,将连接产物进行脱盐浓缩后电转化进行构建.结果表明,未脱盐连接产物的转化效率为1 μL 连接产物有7000个菌落,理论重组率为96%;脱盐后,提升为4.1×10^6个菌落,理论重组率为98%;蓝斑也有插入片段,实际重组率应为100%;插入片段大小平均为1.6 kb.随机挑取500个单克隆(含50个蓝斑)测序,共获得464条EST,单一序列(unigene)为426条,占91.8%,其中片段重叠群26个,单基因400个,冗余率仅为8.1%,表明构建文库的均一化效果较好,可满足后续功能基因的筛选和基因信息的研究.
夜香树 , 均一化cDNA文库 , EST
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